Кафедра ендоскопії та серцево-судинної хірургії створена на базі курсу ендоскопічної та лазерної хірургії кафедри хірургії №1
Клінічними базами кафедри ендоскопії та серцево-судинної хірургії є:
- Вінницька обласна клінічна лікарня ім. М.І. Пирогова (судинне відділення, ендоскопічне відділення, відділення абдомінальної хірургії, Центр лапароскопічної хірургії)
- Військовий медичний клінічний центр Центрального регіону (клініка ендоскопічної хірургії та ендоскопічної діагностики)
- КЗ «Вінницький регіональний клінічний лікувально-діагностичний центр серцево-судинної патології»